Blog

Mutation || Fundamentals of Genetic disorders

আমাদের আশে পাশে genetic disorder আমরা খুব কম খেয়াল করলেও আসলে genetic disorder গুলোর incidence আরো অনেক বেশি। Genetic disorders এর lifetime frequency (পুরো জীবদ্দশায় আক্রান্ত হবার হার) প্রতি হাজারে প্রায় ৬৭০ জন। Spontaneous abortion এর কেইস গুলোর মধ্যে প্রায় অর্ধেকেরই কোনো না কোনো chromosomal abnormality থাকে। তাই genetic disorders সম্পর্কে বিস্তারিত জানা জরুরি হয়ে দাঁড়িয়েছে।

Genetic disorder বুঝতে হলে প্রথমেই mutation কী তা জানা প্রয়োজন। Mutation হচ্ছে permanent change in the DNA. Mutation কে আবার বেশ কয়েকটি ভাগে ভাগ করা যায়।

🔥Coding region এ mutation🔥

  1. Point mutations
    আমরা জানি, genetic code বলতে DNA তে থাকা nitrogenous base এর sequence কে বুঝানো হয়। এই base sequence এর মধ্যে কোনো জায়গায় একটিমাত্র base এ পরিবর্তন হলে তাকে point mutation বলে। যেহেতু base sequence এর উপর depend করে protein synthesis হয়, তাই base sequence এ কোনো পরিবর্তন হলে protein synthesis এও পরিবর্তন আসে। ৩টি base মিলে একটি codon তৈরি করে যা একটিমাত্র amino acid কে নির্দেশ করে বা ক্ষেত্রবিশেষে stop signal দেয় (stop codons – UAA, UAG, UGA)। এই point mutation আবার ৩ রকম হতে পারে –

• Silent (যেখানে base পরিবর্তন এর কারণে নতুন যে codon তৈরি হয় সেটিও same amino acid কেই code করে, ফলে output protein একই থাকে)
• Missense (যেখানে নতুন codon টি ভিন্ন একটি amino acid কে code করে, যদি নতুন amino acid টি আগেরটার সাথে biochemically similar হয় তাহলে function এ খুব বেশি পরিবর্তন হয় না যা conservative missense mutation নামে পরিচিত। অন্যদিকে, নতুন amino acid টি যদি পূর্বের amino acid এর থেকে biochemically different হয় তাহলে function এ আমূল পরিবর্তন আসে যা non-conservative missense mutation নামে পরিচিত)
• Nonsense (যেখানে নতুন codon টি একটি stop codon হওয়ায় truncated protein তৈরি হয়)

2.Deletions and insertions
এখানে কয়েকটি base এর deletion বা insertion হয়। এই deletion বা insertion যদি ৩ বা তার গুনিতক সংখ্যক base নিয়ে হয় তাহলে reading frame এর কোনো পরিবর্তন হয়না শুধু কয়েকটা amino acid এর addition বা subtraction হয়। কিন্তু involved base এর সংখ্যা যদি ৩ এর গুনিতক না হয় তাহলে reading frame টা altered হয়ে যায় এবং mutation এর জায়গা থেকে পরবর্তী সব amino acid পরিবর্তিত হয়ে যায়, একে বলে frameshift mutation।

3.Trinucleotide-repeat mutations
এখানে ৩টি nucleotide এর একটা sequence এর amplification হয়। কোন sequence এর amplificaton হবে তা disorder to disorder vary করে। যেমনঃ fragile X syndrome এ FMR1 (familial mental retardation 1) gene এ CGG base sequence এর ২৫০ থেকে চার হাজার পর্যন্ত repeat থাকে।

🔥Non-coding region এ mutation🔥
Non-coding region যেমন promoters, enhancers, introns ইত্যাদিতেও mutation হতে পারে। Promoter এবং enhancer sequence গুলোতে mutation হলে transcription প্রক্রিয়াতে ঝামেলার সৃষ্টি করে। আবার, intron এর মধ্যে mutation হলে defective splicing হওয়ার সম্ভাবনা থাকে।

অনেক কথা বলে ফেললাম। তো, আজ আমি যাচ্ছি। যাওয়ার আগে কিছু basic term ক্লিয়ারলি বুঝিয়ে যাই।

Hereditary – এসব disorder বাবা/মা এর থেকে সন্তানে transmitted হয়।
Familial – এসব disorder নির্দিষ্ট পরিবার বা বংশে প্রজন্মের পর প্রজন্ম চলতে থাকে।
Congenital – এসব disorder জন্মের সময় থেকেই manifest করে।

মনে রাখা প্রয়োজন যে, hereditary সব disorder ই familial। সব genetic disorderই কিন্তু congenital না (যেমনঃ huntington disease এ জন্মের সময় কোনো features থাকেনা, বয়স ২০-৩০ এর পর গিয়ে manifest করা শুরু করে), আবার সব congenital disorder ও genetic না (যেমনঃ congenital syphilis)।

Reference:
Kumar V, Abbas AK, Aster JC. Robbins and Cotran Pathologic Basis of Disease. Philadelphia, United States: Saunders; 2015. Chapter 5: Genetic Disorders; p137-139.

Platform Academic Divison /

আসাদুল আল গালিব
স্যার সলিমুল্লাহ মেডিকেল কলেজ
সেশনঃ ২০১৬-২০১৭

Leave a Reply